Дейнерис — единственная дочь и младший ребёнок Эйриса II Таргариена и его сестры-жены Рейлы. Безумный король был убит Джейме Ланнистером во время разгрома Королевской Гавани еще до её рождения. Мать Дейнерис и её брат Визерис бежали в Драконий Камень. В ночь, когда родилась Дейнерис, разразился сильный шторм, поэтому её иногда называют Дейнерис Бурерождённой. Когда Рейла умерла, преданный сторонник Таргариенов Уиллем Дарри вывез Дейнерис и Визериса в вольные города, где они рассчитывали найти союзников, которые помогут вернуть Железный трон. В конечном итоге брат с сестрой находят убежище у магистра города Пентос Иллирио Мопатиса.
Дейнерис всегда жила в страхе перед своим братом, который постоянно обвинял её во всех их бедах и порой был крайне жесток. Иллирио Мопатис организует свадьбу кхала Дрого и Дейнерис. Дело в том, что Дрого хочет взять в жёны самую необычную девушку, а взамен готов дать Визерису армию. Визерис говорит сестре, что у неё нет выбора. На свадьбе Дейнерис получает много подарков: Иллирио Мопатис дарит ей окаменевшие драконьи яйца, Джорах Мормонт из Вестероса дарит ей книги из Семи Королевств и предлагает Визерису свои услуги в качестве советника и защитника, Дрого дарит невесте красивую белую лошадь. («Зима близко»)
Кхаласар Дрого начинает свой путь, который длится несколько месяцев. Служанка Дейнерис Дорея учит её, как лучше ублажить мужа. Дейнерис следует совету, и постепенно с помощью своей сексуальности добивается того, что муж начинает считать её равной
В храме дош кхалин Дейнерис приходится съесть сырое сердце лошади. Во время обряда она вновь повторяет, что у неё родится мальчик, и она выбрала ему имя Рейго в честь убитого брата Рейгара Таргариена. Дотракийские предсказатели говорят, что у неё родится кхал кхалов, Жеребец, который покроет весь мир. Визерис ещё больше злится от того, что Дейнерис завоевала любовь дотракийцев. Он приходит на праздник пьяным и требует армию дотракийцев, которые помогут ему вернуть золотую корону. Он угрожает ранить Дейнерис в живот. Дрого говорит, что исполнит просьбу Визериса, но делает это в довольно своеобразной манере. Пока его люди держат Визериса, он плавит в котле золотые украшения и выливает расплавленное золото на голову Визериса, который умирает в муках. Дейнерис замечает, что Визерис не был настоящим драконом, так как огонь не может причинить им вреда. («Золотая корона»)
